深部輸精管壺腹的壁較輸精管薄,內腔亦大,長約3-4厘米,粗直徑可達7-8毫米。在膀胱底部兩側的輸精管壺腹在左右精囊間并列接近,壺腹的末端變細,在前列腺上緣與精囊的排出管匯合而成射精管。輸精管外徑在2毫米左右,管內腔直徑細小不及1毫米。
管壁厚而肌層發達,輸精管管腔及其壺腹內也是貯存精子的場所,性高潮射精時,輸精管有強烈的節律性收縮以軀動管內的精子排出。輸精管堅韌如繩索,在腹股溝管和外環以下的精索內,隔著陰囊壁可自行摸到。常用的男性絕育方法,即在此段做輸精管阻斷術以達到控制生育的目的。輸精管阻斷后,僅是精液內無精子,生活中仍有性高潮和射精活動。
深部輸精管是連接附睪管和射精管的、成熟精子的排出通道,左右各一,每管長約40-50厘米,管壁較厚,肌層比較發達,而管腔細小。輸精管行程較長,按照其行經的部位可分為4部分:
1)睪丸部:是輸精管的起始部,靠近睪丸后緣,為精索靜脈從所包圍自附睪尾端,沿睪丸后緣上行至睪丸上端。
2)精索部:介于睪丸上端和腹股溝管皮下環之間。輸精管位于精索內各結構的后方,此段位于皮下,常為結扎輸精管的部位。
3)腹股溝部:位于腹股溝管內。
4)盆部:為輸精管在經過腹股溝后行于盆腔的部分,此段長。它從腹股溝的腹側環彎向內下,經輸尿管末端前上方至膀胱底的后面。在此,兩側輸精管逐漸接近,并均膨大成輸精管壺腹。